1347年10月,黑死病首次在欧洲抵达西西里,地点是梅西纳(messina)。
在15至18世纪,随着大量来自伯罗奔尼撒(peloponnese)和阿尔瓦尼特人(Arvanites)的大规模移民,西西里再度受到东正教及希腊语和阿尔瓦尼卡语的影响,他们逃避奥斯曼帝国对伯罗奔尼撒的征服而迁移到西西里。
1492年西班牙宗教裁判所的开始,导致费迪南德二世下令驱逐所有西西里的犹太人。
1542年和1693年,岛的东部遭遇了毁灭性地震。
就在后一次地震发生前几年,岛上还遭受了一场瘟疫。
1693年的地震导致估计有六万人遇难。
在17世纪期间发生的几次叛乱被武力镇压,尤其是巴勒莫和梅西纳的叛乱。
北非奴隶袭击使沿海的定居活动受到抑制,直到19世纪。
1713年乌得勒支条约(treatyofUtrecht)将西西里割让给萨沃伊家族(houseofSavoy),然而,这段统治只持续了七年,之后与奥地利哈布斯堡王朝的查理六世交换了撒丁岛。
当奥地利人专注于波兰王位继承战争时,来自西班牙的波旁王子查尔斯。
最初,西西里得以保持作为一个独立王国的个人联盟,而波旁家族则从那不勒斯统治着整个王国。
然而,拿破仑的法兰西第一帝国的到来使那不勒斯在坎波特涅塞战役(battleofcampotenese)中沦陷,波拿巴王国的国王被任命。
波旁家族的费迪南德三世(FerdinandIII)被迫撤退到西西里,他仍在英国海军的保护下掌控着这个岛屿。
随后,西西里加入了拿破仑战争,英国的威廉·本廷克(Lordwilliambentinck)在岛上建立了军事和外交存在,以保护免受法国入侵。
西西里志愿者加入了英国军队,组成了皇家西西里团(RoyalSicilianRegiment),在梅达战役(battleofmaida)中参战,随后转移至伊比利亚半岛。
在战争胜利后,西西里和那不勒斯正式合并为波旁王朝统治下的双西西里(twoSicilies)。
1820年和1848年,反对波旁政府的大规模革命运动在西西里爆发,西西里寻求独立。
其中1848年的革命导致了西西里短暂的独立。
然而,在1849年波旁家族重新夺回了对岛屿的控制,并统治至1860年。
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由朱塞佩·加里波第(GiuseppeGaribaldi)领导的千人远征(Expeditionofthethousand)于1860年占领了西西里,成为复兴运动的一部分。
征服始于马尔萨拉(marsala),当地西西里人加入他攻占意大利南部。